La differenza tra sintesi del DNA e dell'RNA

Sia la sintesi del DNA che dell'RNA si basa sulla strategia di sintesi in fase solida e sulla chimica del fosforamide, un sintetizzatore di DNA potrebbe essere utilizzato per sintetizzare RNA o analoghi dell'RNA senza ulteriori modifiche e i reagenti nella sintesi del DNA potrebbero essere utilizzati direttamente nell'RNA e negli acidi nucleici artificiali ' sintesi.Come mostrato nella Figura 1, il 2'-idrossi nel fosforamide dell'RNA è protetto con il gruppo protettivo silile, ovvero t-butildimetilsilile (TBDMS), prevenendo le reazioni collaterali sul fragile gruppo 2'-idrossi.L'ingombrante gruppo TBDMS ha ostacolato la reazione tra la fosforamide e il gruppo 5'-idrossi sul supporto solido ed è necessario un tempo di accoppiamento più lungo per realizzare l'efficienza di accoppiamento.

Similmente alla sintesi del DNA, l'RNA sintetizzato è stato prima scisso dal supporto solido mediante aminolisi, quindi il gruppo TBDMS è stato scisso dal fluoruro di tetrabutilammonio (TBAF) o dal triidrofluoruro di trimetilammina.L'RNA grezzo potrebbe essere purificato mediante ricristallizzazione da alcol e HPLC.

Sintesi del DNA e dell'RNA1

Figura 1. La struttura chimica degli elementi costitutivi di base nella sintesi del DNA e dell'RNA.

a) fosforamide dABz e b) fosforamide rABz 2'-OTBDMS.
Lo sviluppo del farmaco siRNA richiede che la struttura degli analoghi dell'RNA nativo aumenti la biocompatibilità, il 2'-idrossi sull'RNA potrebbe essere sostituito dai gruppi MeO, F e MOE e anche l'acido nucleico bloccato (LNA) offre buone prestazioni nella terapia con RNA (Figura 2).Questi fosforamiditi forniscono principi attivi simili ai fosforamiditi di tipo DNA nella sintesi e il processo di lavorazione e purificazione di questi acidi nucleici non naturali è simile a quello del DNA nativo.

Sintesi del DNA e dell'RNA2

Figura 2. La struttura chimica degli elementi costitutivi dei farmaci siRNA.a) dABz 2-MeO fosforammidito;b) fosforammidito dABz 2-F;c) fosforamide dABz 2-MOE e d) fosforamide bloccata dABz.

Fosforamiditisono essenziali per la sintesi dei geni, comprese principalmente le famiglie DNA e RNA e i loro derivati, tutte le fosforamiditi di cui sopra possiamo offrirle in un pacchetto.

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Orario di pubblicazione: 09-ago-2022